În ultima parte a trilogiei “Matrix”, pentru care s-au alocat 110 milioane de dolari, omenirea traversează zilele ei cele mai negre. Orașul Zion, ultimul refugiu uman, e în mare pericol. Oamenii nu mai fac față amenințării mașinilor al căror avans e de nestăvilit. Pericolul însă nu vine numai dinspre santinele. Agentul Smith (Hugo Weaving), a cărui putere crește necontenit, se amestecă printre rebeli și este o amenințare atât pentru rasa umană, cât și pentru mașini. Salvarea stă în mâinile lui Neo (Keanu Reeves), captiv într-o misterioasă stație de metrou care face legătura între Matrix și lumea reală. El este ajutat să iasă de acolo de Trinity (Carrie-Anne Moss) și de Morpheus și astfel ajunge în fața Oracolului.