„Am avut o relaţie cu o fată multă vreme, când eram în liceu. Cum arătam, mă îmbrăcam şi mă purtam, şi relaţia pe care o aveam – toate îi şocau pe oameni. Dacă aş fi crezut că sunt lesbiană 100%, oare ar fi fost o experienţă diferită? E posibil ca atitudinea mea în legătură cu asta să fi avut ca sursă faptul că ştiam că încă îmi plac băieţii”, a povestit aceasta.
Anderson spune că relaţiile de acelaşi sex au fost excepţia în cazul ei, nu regula. Actriţa are trei copii: Piper Maru (17 ani, cu primul ei soţ, Clyde Klotz, pe care la cunoscut la filmările pentru „Dosarele X”), Oscar (5 ani) şi Felix (3 ani) – cu iubitul ei de acum, Mark Griffiths.
Gillian a mai fost căsătorită cu realizatorul de documentare Julian Ozanne (2004-2006).