În ultimul episod al sezonului 1, David Robert Jones o împușcă pe Nina Sharp în lift și îi fură o capsulă de energie pe care William Bell o implantase în mâna femeii. Toate acestea pentru a crea o realitate paralelă și a se confrunta cu William Bell. După ce își revine în urma împușcăturii, Nina îi cere ajutorul Oliviei. Walter pleacă alături de cel pe care Olivia îl numește Observatorul. După căutări, Peter își întâlnește tatăl la casa de pe plajă. Olivia îl întâlnește, în sfârșit, pe William Bell.